La sociedad de Kirika y Mireille ha llegado a su fin, y sin un lugar al que regresar, Kirika se encuentra deambulando por el desierto. Encontrada y rescatada, la llevan a lo que parece ser un simple pueblo rural. Sin embargo, cuando Kirika se da cuenta de que todos los aldeanos no solo la reconocen, sino que han estado esperando su llegada, queda claro que no todo es lo que parece.